超聲波細胞粉碎機是指利用外力破壞細胞膜和細胞壁，使細胞內容物包括目的的產物成分釋放出來的技術，是分離純化細胞內合成的非分泌型生化物質的基礎，由于細菌、酵母、真菌、植物細胞壁的組成成分不同，且同類細胞竭誠的網狀結構也不同，所以其細胞壁的堅固程度不同。
而動物細胞雖沒有細胞壁，但具有細胞膜，也需要一定的細胞破碎方法來破膜，以此達到提取產物的目的。下面就列舉了幾個重要的方法，可供參考：
1. 機械法
1.1 組織搗碎
將材料配成稀糊狀液，放置于筒內約1/3體積，蓋緊筒蓋，將調速器先撥至最慢處，開動開關后，逐步加速至所需速度。一般用于動物組織、植物肉質種子、柔嫩的葉芽等，轉速可高達10000rpm/M以上。由于旋轉刀片的機械切力很大,制備一些較大分子如核酸則很少使用
1.2 勻漿器
先將剪碎的組織置于管中，再套入研桿來回研磨，上下移動，即可將細胞研碎。勻漿器的研缽磨球和玻璃管內壁之間間隙保持在十分之幾毫米距離。制作勻漿器的材料，除玻璃外，還可以用硬質塑料、不銹鋼、人造熒光樹脂等。
此法細胞破碎程度比高速組織搗碎機為高，適用于量少和動物臟器組織。
存在的問題：較易造成堵塞的團狀或絲狀真菌，較小的革蘭氏陽性首以及有些亞細胞器，質地堅硬，易損傷勻漿閥，也不適合用該法處理。
1.3 研缽
多用于細菌或其他堅硬植物材料，研磨時常加入少量石英砂，玻璃粉或其他研磨劑，以提高研磨效果。
1.4 細菌磨
是一種改良了的研磨器，比研缽具有更大的研磨面積，而且低部有出口。操作時先把細菌和研磨粉調成糊狀，每次加入一小勺，研磨20-30秒即可將細菌細胞完全磨碎。
2. 化學及生物化學法
2.1自溶法
在一定PH和適當的溫度下，利用組織細胞內自身的酶系統將細胞破碎的方法。此過程需較長時間，常用少量防腐劑如甲苯、氯仿等防止細胞的污染。
2.2 酶溶法
利用各種水解酶，如溶菌酶、纖維素酶、蝸牛酶、半纖維素酶、脂酶等，將細胞壁分解，使細胞內含物釋放出來。有些細菌對溶菌酶不敏感，加入少量巰基試劑或8摩爾尿素處理后，使之轉為對溶菌酶敏感而溶解。
2.3 化學滲透法
某些有機溶劑(如苯、甲苯)、抗生素、表面活性劑、金屬螯合劑、變性劑等化學藥品都可以改變細胞壁或膜的通透性從而使內合物有選擇地滲透出來。其作用機理;化學滲透取決于化學試劑的類型以及細胞壁和膜的結構與組成。
3. 物理法
3.1 反復凍溶法
原理：因突然冷凍，細胞內冰晶的形成及胞內外溶劑濃度的突然改變而破壞細胞。
方法：將待破碎的細胞在-20度以下冰凍，室溫融解，反復幾次，由于細胞內冰粒形成和剩余細胞液的鹽濃度增高引起溶脹，使細胞結構破碎。
3.3 急熱驟冷法
將材料投入沸水中，維持85-90分鐘，至水浴中急速冷卻，此法可用于細菌及病毒材料。
就目前超聲波儀器主要有超聲波振蕩器以及超聲波粉碎儀等。
其優點是保持細胞活性，省時，樣品損失少，可以處理大量樣品。因此超聲波細胞粉碎儀的不斷發展和改進，對大規模生產的貢獻是十分可觀的。 超聲波細胞粉碎儀進行超聲粉碎破碎是目前在生物生產中最常用的破碎方法。對不同菌種的發酵液。超聲破碎的效果差別較大。一般地，桿菌比球菌較易破碎，革蘭氏陰性細菌細胞比革蘭氏陽性細菌細胞較易破碎，對酵母菌的效果較差。
超聲波細胞粉碎機的優點：操作簡便，液量損失少，適合實驗室規模。缺點：成本高;易引起溫度的劇烈上升;在大規模操作中，聲能傳遞和散熱困難，產生的化學自由基團易使產物失活，所以其影響了其在大規模的工業上的應用。
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